X-COM: Apocalypse

Een halve eeuw na het einde van de tweede X-COM campagne, heeft de laatste slag van T'leth de biosfeer van de aarde ernstig beschadigd. Als gevolg daarvan werden verschillende zelfstandige Megalopolis-achtige steden voorgesteld om de mensheid te bewonen. Het spel volgt Mega-Primus, de eerste van deze steden, gebouwd over de ruïnes van Toronto, Canada. Ondertussen wordt de buitenaardse kolonie Mars geëxploiteerd door het mijnbedrijf Elerium, Solmine, en onderdrukt door MarSec (Mars SECurity). De buitenaardse dreiging in het spel wordt gepresenteerd door een nieuw ras van organische, extradimensionale buitenaardse wezens die aanvankelijk lijken geen relatie te hebben met de aliens van de vorige twee games, hoewel latere missies ingesteld in de buitenaardse dimensie onthullen dat ze tot slaaf Sectoid overlevenden. Deze nieuwe aliens vallen de stad aan door tetraëdervormige teleportpoorten. De speler moet ontdekken hoe hij zijn eigen vliegtuig, samen met X-COM agenten, door deze poorten moet sturen zonder vernietigd te worden en de oorlog naar de aliens te brengen. Apocalypse heeft 14 rassen van buitenaardse wezens waaronder Anthropods, Brainsuckers, Hyperwormen, Megaspawns en Micronoïden. Elk ras heeft verschillende sterke en zwakke punten, en sommige rassen zijn afhankelijk van andere rassen. De "vreemde levenscyclus" speelt een cruciale rol in het spel. De speler wordt blootgesteld aan deze "vreemde levenscyclus" door onderzoek en nog belangrijker de lagere niveau buitenaardse aanvallen tijdens het verzamelen van monsters strijd. In de eerste plaats de aanval van de bewapende alien de Brain-Sucker die individuen aanvalt na de landing van een pod-lanceerder gebruikt door buitenaardse voet soldaten. De Hersen-Sucker broedt uit en valt het dichtstbijzijnde individu aan door op hun hoofd te springen en er schijnbaar iets in te injecteren door de mond en direct na de poging dood te gaan. De levenscyclus neemt later een mysterieuze wending omdat het geen verband laat zien tussen de lagere buitenaardse vormen en hogere buitenaardse vormen. Uiteindelijk, echter, wordt gevonden dat de leiders van de invasie zijn de Micronoïden, een ras van sapient eencellige organismen die leven in de bloedstromen van de andere aliens; het uiteindelijke doel van de invasie is om Micronoïden te injecteren in de bloedstromen van belangrijke figuren, waardoor ze Mega-Primus te controleren door middel van psionische overheersing van hun gastheren. De speler is uiteindelijk belast met het binnenvallen van de thuiswereld van de aliens en het vernietigen van hun kant van de poort als de enige manier om de Micronoïde besmetting te stoppen.