Mega Man Zero

Meer dan een eeuw na Sigma’s nederlaag in de Mega Man X-serie werd een nieuwe regering, Neo Arcadia, gevormd om de vrede te handhaven. De leiders van Neo Arcadia begonnen onrechtvaardig reploïden te jagen, die ze ten onrechte als Mavericks bestempelden. De enige hoop voor de reploïden is een legendarische reploid: de Rode Held, bekend als Zero. Toen Ciel voelde dat de reploïden onterecht werden beschuldigd, vluchtte ze uit Neo Arcadia en vormde een weerstand tegen de regering. Het spel begint als Ciel en een klein groepje weerstandsstrijders wordt achtervolgd door Pantheons en Golems. Enkele weerstandsstrijders raken achterop, maar ze kunnen hun vooruitgang niet stoppen. Achtervolgd, bereikt Ciel een enorme deur. Passy, haar Cyber-elf, zegt: "Ik voel een sterke energie vandaan. Dit moet de plaats zijn." Vervolgens laten soldaten de deur ontploffen, en Ciel, Passy en Milan betreden de kamer, waar het levenloze lichaam van Zero in het midden ligt, inactief voor 100 jaar. Milan probeert het aan te raken, maar wordt weggeslingerd door een energiescherm dat Zero beschermt. Terwijl ze proberen te begrijpen hoe ze het scherm kunnen omzeilen, verschijnen Pantheons aan de deur. Milan beveelt Ciel om te vluchten, en sterft, geraakt door een van de Pantheons. Passy zegt tegen Ciel: "Je moet mijn kracht gebruiken. Je hebt geen keuze." Ciel denkt na terwijl de Pantheons dichterbij komen, en stemt treurig in. Passy’s offer breekt het energiescherm en brengt Zero weer tot leven. Hij helpt Ciel en ontdekt dat Mega Man X (hoewel het eigenlijk een kopie is) verantwoordelijk is voor het pensioneren van onschuldige reploïden.