Mega Man Zero

Più di un secolo dopo la sconfitta di Sigma nella serie Mega Man X, un nuovo governo chiamato Neo Arcadia fu formato per mantenere la pace. I leader della Neo Arcadia iniziarono a cacciare i Reploid ingiustamente etichettandoli come Mavericks. Ora l'unica speranza per i Reploid è un leggendario Reploid: l'Eroe Rosso chiamato Zero. Sentendo che i Reploid venivano accusati ingiustamente, Ciel fugge dalla Neo Arcadia e crea una Resistenza contro di essa. Il gioco inizia mentre Ciel e un piccolo gruppo di soldati della resistenza vengono inseguiti dai Pantheons e dai Golems. Alcuni dei soldati della resistenza rimangono indietro, ma non possono fermare l'avanzata. Inseguiti, Ciel raggiunge una grande porta. Passy, la sua Cyber-elf, dice: "Sento una forte energia emanare da qui. Questo deve essere il posto." Dopo di ciò, i soldati fanno esplodere la porta, e Ciel, Passy e Milan entrano nella stanza, con il corpo inanimato di Zero al centro, inattivo per 100 anni. Milan prova a toccarlo, ma viene respinto dallo scudo energetico che protegge Zero. Mentre cercano di capire come superare lo scudo, i Pantheons appaiono alla porta. Milan ordina a Ciel di scappare, e muore, colpito da uno dei Pantheons. Passy dice a Ciel: "Dovrai usare il mio potere. Non hai scelta." Ciel riflette mentre i Pantheons si avvicinano sempre di più, e acconsente con tristezza. Il sacrificio di Passy spezza lo scudo energetico e riporta in vita Zero. Lui aiuta Ciel, e scopre che Mega Man X (anche se in realtà una copia) è responsabile del ritiro degli innocenti Reploids.