Syphon Filter 2

Peu après les événements du premier jeu, Gabriel Logan et Lian Xing deviennent des cibles de l'Agence après avoir révélé son implication dans Syphon Filter, étant désormais traqués comme des terroristes. L'agent Dillon Morgan capture Lian dans les entrepôts PharCom, forçant Gabe et les soldats du CBDC à rejoindre l'ancienne agente Teresa Lipan en Arizona. Pendant ce temps, l'Agence envoie une escadrille de F-22 Raptor pour intercepter leur transport au-dessus des Rocheuses du Colorado. Gabe et le lieutenant Jason Chance descendent de la montagne à la recherche de leur avion et d'une boîte de disques de données PharCom. L'agent Steven Archer tente de les arrêter à tout prix. Un groupe de conspirateurs, incluant Mara Aramov et le directeur de l'Agence Lyle Stevens, négocie la livraison du virus à un général chinois renégat nommé Shi-Hao. Pendant ce temps, Lian se remet dans une base de l'US Air Force où Morgan, Derek Falkan et Thomas Holman collaborent avec la docteure Elsa Weissinger de PharCom pour extraire du plasma infecté de sujets de test. Lian découvre que l'autre sujet était Jonathan Phagan, PDG de PharCom, qui a survécu assez longtemps pour que l'Agence récupère son plasma. Weissinger proteste, affirmant que Phagan est utile et doit rester en vie pour de futures recherches. Cependant, Morgan, ne voulant pas que le gouvernement américain découvre que le PDG de PharCom est infecté par un virus inconnu, débranche son soutien-vie, éliminant ainsi un témoin gênant. Lian s'échappe du bâtiment médical et interroge Holman, apprenant que Morgan prépare une autre opération au centre d'exposition PharCom pour retrouver un disque d'encryption. Après avoir tué Falkan, elle quitte la base en hélicoptère et rejoint Gabe pour combattre les forces d'Archer. Gabe abat Archer lors de sa fuite et récupère les données PharCom. Les protagonistes suivent Holman jusqu'au centre d'exposition et tuent Morgan avant qu'il ne puisse récupérer le disque qu'il recherchait. Après avoir décrypté les données PharCom, Teresa réalise qu'une partie des informations manque. L'autre moitié doit être en possession d'Uri Gregorov, directeur du SVR russe, qui était présent dans les entrepôts avant le départ de Gabe. Comme Lian et Uri se connaissent, ils conviennent de se rencontrer à Moscou. Aramov provoque une fusillade pendant leur rencontre, et Lian poursuit Gregorov. Plus tard, elle découvre qu'il s'agit d'un imposteur travaillant pour Mara et cherchant l'autre moitié des données. L'homme avoue que le vrai Gregorov est emprisonné dans un goulag russe, la prison d'Aljir, où Lian a autrefois été détenue. Gregorov avait découvert un complot visant à vendre le virus à Shi-Hao, ce qui a poussé Aramov à intervenir. Lian arrête l'exécution de Gregorov, mais est presque tuée par le virus et s'effondre. Gabe la ramène aux États-Unis, tandis que Gregorov promet de s'occuper de Shi-Hao. Gabe et Teresa retournent au safehouse de Virginie, supervisé par Lawrence Mujari, un pathologiste indépendant. Ils ont échangé les données PharCom contre le vaccin de Lian. Le directeur Stevens trahit Gabe dans les laboratoires de l'Agence à New York, mais Logan s'échappe et force la docteure Weissinger à lui donner le vaccin. Gabe découvre également que Chance a survécu à la mission en Colorado, ce qui le libère de ses obligations. Poursuivi par des policiers SWAT et des agents de l'Agence, Gabe se précipite vers leur hélicoptère. En chemin, Logan doit couvrir un officier SWAT dont le partenaire est blessé. Il le fait, mais Stevens, qui prend ensuite l'officier en otage, ordonne à Gabe de déposer ses armes. Malgré sa reddition, Stevens tue l'officier. Avant que Gabe ne puisse être abattu, une explosion déclenchée par Teresa le projette dans les égouts. Gabe suppose que Chance a été tué dans les laboratoires, car Teresa affirme qu'il n'a jamais atteint l'hélicoptère. Gabe et Teresa finissent par coincer Stevens, et Gabe le tue de sang-froid. En arrivant à l'hélicoptère, ils trouvent Chance les attendant, vêtu d'une armure corporelle imprenable fournie par l'Agence. Il travaillait pour eux et tire sur Teresa. Gabe le soupçonnait depuis que l'Agence avait toujours su où il se trouvait dans le Colorado. Les deux hommes s'affrontent, et Gabe tue l'homme en qui il avait confiance avec un fusil d'assaut qui projette Chance dans les pales de l'hélicoptère, lui tranchant la tête. Un reportage d'actualité révèle que l'existence de l'Agence est désormais publique, et le secrétaire d'État américain Vincent Hadden promet que le gouvernement enquêtera. Gabe soigne Lian et marque une tombe pour Teresa. Lui, Lian et Lawrence organisent une petite cérémonie commémorative et promettent de continuer le combat tandis que des soldats les observent de loin. Dans une scène post-générique, Hadden et Aramov émergent d'un hélicoptère, avec Aramov déclarant que l'administration va bientôt tomber, permettant à Hadden de devenir président. Bien qu'une équipe de soldats demande l'autorisation de tuer Gabe et son équipe, Hadden annule l'opération, disant à Mara qu'il a d'autres projets pour Gabe. Aramov rit tandis que l'écran s'assombrit.