Sonic Advance 3

Antes dos eventos do jogo, o Dr. Eggman constrói um assistente robótico chamado Gemerl, usando partes do robô Emerl, que foi destruído em Sonic Battle. Eggman tenta um experimento usando as Esmeraldas do Caos para realizar a técnica Chaos Control, mas algo corre mal e rasga o mundo. Essa ação separa Sonic e Tails de Amy, Knuckles e Cream, que Eggman encontra e captura, com a intenção de criar um segmento do seu império iminente em cada pedaço do planeta. Sonic e Tails viajam pelos sete níveis do jogo para resgatar seus amigos e recuperar as Esmeraldas. A batalha final contra o chefe ocorre no templo da Esmeralda do Altar. Se o jogador derrotar Eggman ali sem ter todas as sete Esmeraldas do Caos, Eggman e Gemerl fogem e caem da borda do templo. A paz é restaurada ao mundo, e Omochao tira uma foto dos cinco heróis. No entanto, o jogo alerta o jogador de que as Esmeraldas ainda devem ser coletadas para o verdadeiro final. Se o jogador derrotar Eggman no templo com todas as Esmeraldas do Caos, Gemerl para de fugir com Eggman e ataca Sonic, fazendo com que as Esmeraldas se espalhem. Gemerl usa-as para assumir uma forma gigante em formato de esfera, mas Sonic também usa seu poder para atingir sua forma Super Sonic. Com a ajuda de Eggman, o Super Sonic destrói Gemerl. Mais tarde, Tails encontra o corpo quebrado de Gemerl em uma praia, reparando e reprogramando-o. O jogo termina com Cream brincando com o agora não agressivo Gemerl na casa da mãe dela, Vanilla.