Sonic Advance 3

Antes de los eventos del juego, el Doctor Eggman construye un asistente robótico llamado Gemerl, utilizando piezas del robot Emerl, destruido en Sonic Battle. Eggman intenta un experimento usando las Esmeraldas del Caos para realizar la técnica Chaos Control, pero este falla y desgarra el mundo. Esta acción separa a Sonic y Tails de Amy, Knuckles y Cream, a quienes Eggman encuentra y captura, con la intención de crear un segmento de su imperio inminente en cada fragmento del planeta. Sonic y Tails viajan a través de los siete niveles del juego para rescatar a sus amigos y recuperar las Esmeraldas. La batalla final contra el jefe tiene lugar en el templo de la Esmeralda Altar. Si el jugador derrota a Eggman allí sin tener las siete Esmeraldas del Caos, Eggman y Gemerl escapan y caen del borde del templo. La paz se restablece en el mundo, y Omochao toma una foto de los cinco héroes. Sin embargo, el juego alerta al jugador de que las Esmeraldas aún deben ser recolectadas para el verdadero final. Si el jugador derrota a Eggman en el templo con todas las Esmeraldas del Caos, Gemerl deja de huir con Eggman y ataca a Sonic, haciendo que las Esmeraldas se dispersen. Gemerl las usa para adoptar una forma gigante y esférica, pero Sonic también usa su poder para convertirse en Super Sonic. Con la ayuda de Eggman, Super Sonic destruye a Gemerl. Más tarde, Tails encuentra el cuerpo roto de Gemerl en una playa, lo repara y lo reprograma. El juego termina con Cream jugando con el ahora no agresivo Gemerl en la casa de su madre, Vanilla.