Jak 3

Het spel begint met Jak en Daxter die door de tirannieke Graaf Veger verbannen worden naar de Woestijn wegens vermeende misdaden tegen Haven City. Ashelin, die zich verzet tegen de verbanning, geeft Jak een vuurtoren voordat ze vertrekt en zegt tegen hem: „Blijf in leven“. Terwijl ze door de woestijn reizen, onthullen flashbacks dat Haven City in oorlog is tussen de Vrijheidsliga en de overgebleven Metal Heads en hun bondgenoten, de KG Death Bots. Daarna wordt het Paleis verwoest door een onbekende kracht. Jak, Daxter en Pecker verliezen het bewustzijn, maar worden gered door een groep woestijnbewoners, die hen meenemen naar Spargus City. Bij het ontwaken in Spargus zegt koning Damas tegen Jak dat hij zijn plaats in de beschaving moet verdienen door zich te bewijzen als krijger, zowel in Arena-uitdagingen als door de stad te dienen, waarvan zijn „leven nu deel uitmaakt“ omdat hij is gered. Zijn missies omvatten het herwinnen van artefacten na zandstormen, races met buggies en Leaper lizards voor upgrades, Eco-kristallen en buggies, het vangen van Kanga-ratten op een Leaper lizard, en verschillende andere vreemde klusjes in de oase. Het belangrijkste hiervan is dat Jak de Light Eco-krachten krijgt om de duisternis binnenin hem in evenwicht te brengen, toegekend door een orakel in de Precursor-tempel die gelooft dat Jak de laatste hoop voor de beschaving is. Deze krachten omvatten tijdvertraging, genezing, schilden en zelfs vlucht. Onderweg maakt Jak vrienden met de Precursor-monnik Seem en een buggy-garage-eigenaar, Kliever – die hem aanvankelijk niet kunnen lijden tot hij hun vertrouwen wint. Tijdens een van Damas' missies in de woestijn vindt Ashelin Jak, die onthult dat ze wist dat Damas hem zou vinden omdat ze wist dat hij zijn oude vuurtorens zou controleren. Ze weigert te vertellen hoe ze Damas kent en smeekt Jak om terug te keren naar Haven City om het te verdedigen tegen de Metal Heads en de nieuwe Krimzon Guard Deathbots. Jak, nog steeds verbitterd door zijn verbanning, weigert te terugkeren. Ashelin vertrekt, maar later, nadat hij ontdekt wat de slechte Graaf Veger voor zijn vrienden in petto heeft, verandert Jak van gedachten en maakt de reis naar Haven City via transport. Jak en Daxter helpen de weerstand in Haven te herenigen, die is verdeeld door barrières opgezet door vijanden, en geven hen hoop dat ze de Metal Heads en Deathbots kunnen verslaan.