Jak 3

El juego comienza con Jak y Daxter siendo desterrados al Desierto por el tiránico Conde Veger por supuestos crímenes contra la Ciudad de Haven. Ashelin, quien se opone al destierro, le entrega a Jak un faro antes de irse y le dice "quédate con vida". Mientras viajan por el desierto, flashbacks revelan que la Ciudad de Haven está en guerra entre la Liga de la Libertad y los Metal Heads supervivientes, junto con sus aliados, los KG Death Bots. El Palacio es luego destruido por una fuerza desconocida. Jak, Daxter y Pecker pierden el conocimiento, pero son rescatados por un grupo de habitantes del desierto, quienes los llevan de vuelta a la Ciudad de Spargus. Al despertar en Spargus, el Rey Damas le dice a Jak que debe probar su valía como guerrero tanto en los desafíos de la Arena como sirviendo a la ciudad, a la cual "su vida ahora pertenece" por haber sido rescatado. Sus misiones implican recuperar artefactos después de tormentas de arena, carreras con buggies y lagartos Leaper para actualizaciones, cristales Eco y buggies, atrapar ratas Kanga sobre un lagarto Leaper, y varios otros trabajos en la ciudad oasis. El evento más importante entre estos es que Jak recibe las habilidades Light Eco para equilibrar la oscuridad interior, otorgadas por un oráculo en el templo Precursor, quien cree que Jak es la última esperanza de la civilización. Estos poderes incluyen ralentizar el tiempo, poderes de curación, escudos y hasta vuelo. En el camino, Jak se hace amigo del Monje Precursor, Seem, y de un dueño de taller de buggies, Kliever — quienes inicialmente lo desconfían hasta que gana su confianza con el tiempo. Durante una de las misiones de Damas en el desierto, Jak es encontrado por Ashelin, quien revela que sabía que Damas lo encontraría porque sabía que revisaría sus faros antiguos. Se niega a decirle cómo conoce a Damas y luego suplica a Jak que regrese a la Ciudad de Haven para defenderla de los Metal Heads y los nuevos Deathbots Krimzon Guard. Aunque aún resentido por su exilio, se niega a volver. Ashelin se va, pero más tarde, tras descubrir lo que el malvado Conde Veger tiene planeado para sus amigos, Jak cambia de opinión y emprende el viaje hacia la Ciudad de Haven. Jak y Daxter ayudan a reunificar la resistencia en Haven, dividida por barreras impuestas por los enemigos, y les dan esperanza de que puedan derrotar a los Metal Heads y Deathbots.