The Binding of Isaac

La trama de The Binding of Isaac está inspirada libremente en el relato bíblico del mismo nombre. Isaac, un niño, y su madre viven en una pequeña casa en una colina, ambos felices y viviendo en paz, mientras Isaac dibuja y juega con sus juguetes, y su madre ve programas cristianos en la televisión. La madre de Isaac entonces escucha "una voz desde arriba", que le dice que su hijo está corrompido por el pecado y necesita ser salvado. Le pide que elimine todo lo malo de Isaac, en un intento por salvarlo. Su madre obedece, quitándole sus juguetes, dibujos e incluso su ropa. La voz vuelve a hablarle a la madre de Isaac, diciendo que Isaac debe ser separado de todo lo malo del mundo. Nuevamente, su madre obedece y encierra a Isaac en su habitación. La voz habla una vez más con la madre de Isaac. Le dice que ha hecho bien, pero aún cuestiona su devoción y le pide que sacrifique a su hijo. Ella obedece, agarrando un cuchillo de carnicero de la cocina y dirigiéndose a la habitación de Isaac. Isaac, observando a través de una grieta considerable en su puerta, comienza a entrar en pánico. Descubre una trampilla escondida bajo su alfombra y salta hacia abajo, justo antes de que su madre abra la puerta de su habitación. Isaac luego pega el dibujo que estaba haciendo en la pared, lo que se convierte en la pantalla de título del juego. Durante los puntos de carga del juego, Isaac es mostrado enroscado en una bola, llorando. Sus pensamientos son visibles, variando desde el rechazo de su madre y la humillación de sus compañeros hasta un escenario en el que él mismo muere. El juego presenta 13 finales, uno después de cada combate con un jefe principal.