Teenage Mutant Ninja Turtles (2003)

La jugabilidad se basa libremente en los siguientes episodios de la primera temporada: «Things Change», «A Better Mouse Trap», «Attack of the Mouser’s», «Meet Casey Jones», «Nano», «Darkness on the Edge of Town», «The Way of Invisibility», «Notes From the Underground» (Partes 1-3) y «Return to New York» (Partes 1-3), además de un nivel que no está basado en la serie animada. Tras la destrucción de su antiguo hogar por parte de robots cazadores, las tortugas buscan un nuevo refugio. Michelangelo termina irritando a Raphael, quien decide subir a la superficie, donde se enfrenta a matones de Purple Dragon, Casey Jones y Dragonface. Baxter Stockman usa ninjas invisibles para capturar a Raphael, y Donatello debe rescatarlo. Mientras Raphael y Michelangelo se enfrentan por diversión, Donatello analiza un cristal extraño encontrado en su hogar, notando que parece una célula cerebral mutada. Raphael patea a Michelangelo contra una pared, revelando un gran túnel detrás. El cristal de Donatello comienza a brillar, y las tortugas deciden investigar. Siguiendo el túnel, se encuentran con humanos mutados genéticamente. Tras algunos enfrentamientos con estos mutantes, las tortugas descubren que fueron transformados en su estado actual por experimentos científicos previos de los científicos de Shredder. Los cristales que Donatello encontró son lo único que mantiene con vida a estos mutantes, quienes no pueden abandonar su hogar subterráneo. Suplican a las tortugas que derroten a Shredder para que ningún otro humano sufra como ellos. Las tortugas deciden derrotar a Shredder de una vez por todas y prometen a los mutantes que volverán por ellos si alguna vez encuentran una manera de revertir su condición.