Ecco the Dolphin

Spelet börjar med Ecco, en tumlare, som simmar i sin hemvikt tillsammans med sin flock. En flockkamrat utmanar Ecco till ett spel för att se hur högt han kan hoppa i luften. När han är i luften bildas en jättelik vattenvirvel som suger upp all marinliv i viken förutom Ecco, vilket lämnar honom ensam. När han lämnar viken simmar Ecco omkring och möter andra havslevande djur, inklusive andra delfiner som berättar att de känner av stormen och att hela havet är i kaos. En orka Ecco möter berättar för honom att resa till Arktis för att träffa "Stora Blåa", en gammal blåval som är äldre och visare än alla andra havslevande djur, som kanske kan hjälpa honom på hans resa. Efter en lång resa genom havet anländer Ecco till Arktis och finner Stora Blåa, som berättar för delfinen att stormarna inträffar varje 500:e år. Även om Stora Blåa inte vet vad som orsakar stormarna, föreslår han att Ecco letar efter Asteriten, jordens äldsta livsform. Ecco lämnar Arktis och reser till en djup grotta där han hittar Asteriten. Asteriten hälsar på Ecco och berättar att även om den har kraften att hjälpa honom, så kan den inte göra det eftersom klot från dess kropp har gått förlorade. Asteriten berättar för honom att resa till Atlantes försvunna ruiner och använda tidmaskinen som lämnats efter sig av atlanterna. Ecco reser till den försvunna staden Atlantis, där han upptäcker en gammal bibliotek fyllt med Glyfer, stora kristaller som innehåller information. Från biblioteket lär sig Ecco ursprunget till stormarna: en utomjordisk ras, kallad Vortex, förlorade förmågan att producera mat på sin planet, så varje 500:e år när planeterna ställer sig i linje, använder de sin teknologi för att skörda jordens vatten. Atlanterna förde ett långt krig mot Vortex, som slutade när en stråle träffade Atlantis från rymden och sänkte staden till havets djup. Efter att ha lärt sig detta aktiverar Ecco tidmaskinen och reser 55 miljoner år tillbaka i jordens historia. Medan Ecco är i det förflutna lär han sig en gammal sång för att kunna kommunicera med en Pteranodon. Ecco hittar Asteriten i det förflutna, men blir omedelbart attackerad av den. Tvingad att slåss lyckas han lossa en klot från den. Detta öppnar en tidportal och han skickas tillbaka till nutiden. Efter att ha fått klotet ger Asteriten Ecco kraften att omvandla sin sonar till ett dödligt vapen mot Vortex, samt förmågan att andas under vatten och långsamt regenerera förlorad hälsa. Asteriten instruerar honom att använda tidmaskinen för att resa tillbaka i tiden till skördetimmen. Den här gången lyckas han bli sugen in i vattenvirveln med sin flock. Ecco skjuts iväg genom rymden till en jättelik rörliknande maskin. Genom att ta sig igenom konstruktionen anländer Ecco till planeten Vortex och engagerar sig i strid med utomjordingarna. Han tar sig fram till Vortex Drottningen och utkämpar en kamp mot henne. När drottningen besegras spyr hon ut Eccos flock som hon hade ätit upp, och de gör en snabb flykt tillbaka till jorden.