The Punisher

In de inleiding geniet Amerikaanse marinekapitein Frank Castle van een picknick met zijn familie in Central Park. Frank en zijn gezin worden echter per ongeluk getuige van een moord door de mafia en worden daarbij vermoord. Om wraak te nemen op de dood van zijn familie wordt Frank een wreker bekend als The Punisher, die een eenmansoorlog voert tegen criminaliteit. Het spel begint in een illegale casino en op de straten van New York, waar The Punisher (optioneel vergezeld door S.H.I.E.L.D.-agent Nick Fury) de mafiahandlanger Bruno Costa achtervolgt, die de opdracht gaf om The Punisher's familie te vermoorden. De achtervolging culmineert in een gevecht met Chester Scully (een kleine schurk uit de strips), die The Punisher 'verhoort' tot hij de benodigde informatie krijgt, waarna hij Scully neerschiet. Terwijl hij nog op zoek is naar Bruno, dringt The Punisher de mafia's Pantaberde resort in Florida binnen via een waterleiding. Hij bakt een hotel binnen en confronteert Bruno, die plotseling wordt vermoord door Guardroid, een robot die Kingpin heeft geprogrammeerd om The Punisher te elimineren. Na Guardroid te hebben verslagen, bestormt The Punisher een grote drugs-smokkelring in een lokale haven, wat resulteert in een confrontatie met Bonebreaker in een pakhuis aan de waterkant. Daarna valt The Punisher het Kingpin's papaverveld aan in een grot in Arizona. The Punisher bestijgt en vernietigt een goederentrein onder commando van Bushwhacker. Op dit punt besluit Kingpin dat hij genoeg handlangers en geld heeft verloren aan The Punisher's acties. Hij zet een grote beloning op The Punisher's hoofd, die vervolgens wordt achtervolgd door huurmoordenaars van zijn schuilplaats en door een bos. Na een andere Guardroid te hebben verslagen, dringt The Punisher het King Building binnen, vecht zich een weg door Jigsaw en andere vijanden heen tot de finale confrontatie met Kingpin zelf. Na Kingpin's nederlaag stort het hele torencomplex in, maar Kingpin wordt niet gevonden tussen de vele dode criminelen in de puinhopen.