Assassin's Creed: Bloodlines

Kort na het einde van het eerste spel ontdekt Altaïr Ibn-La'Ahad een plan van de overgebleven Tempeliers om te vluchten naar Cyprus, en infiltreren daarom een van hun vestingen in Akko om hen te stoppen. Hoewel hij daar niet in slaagt, verslaat en gevangennemt hij Maria Thorpe, die probeerde wraak te nemen op haar voormalige meester Robert de Sablé, die door Altaïr werd gedood. Na een schip te hebben gecharterd, vaart Altaïr ook naar Cyprus om de appel te achtervolgen, met Maria in zijn gezelschap. Daar verneemt hij van de aanwezigheid van Armand Bouchart, die Robert de Sablé is opgevolgd als grootmeester van de Tempelierorde. Altaïr ontdekt ook en krijgt steun van een verzetsbeweging in de stad die zich verzet tegen de Tempeliers, die na het kopen van het eiland van koning Richard een onderdrukkende regering hebben gevormd om het land en zijn inwoners te controleren. Hij hoort ook over een Tempelier-'archief', een schat aan Tempelierkennis en artefacten, verborgen ergens op het eiland. Getrouw aan de weg van de Assassijnen probeert Altaïr zowel het archief te lokaliseren als Cyprus te bevrijden van Boucharts greep, door eerst zijn ondergeschikten te doden: Frederick 'de Rode', Moloch 'de Stier', Shalim en Shahar 'de Tweeling' en de Donkere Oraakel 'de Heks'. Uiteindelijk confronteert en verslaat hij Bouchart in het archief, waarvan de inhoud is geëvacueerd en verplaatst door Tempeliersoldaten. Na Boucharts dood begint het archief in te storten, maar Altaïr weet te ontsnappen. Het spel onthult ook de relatie tussen Altaïr en Maria. Maria is aanvankelijk vijandig en sarcastisch tegenover Altaïr (in haar eigen woorden: 'de man die mijn nek redde, maar mijn leven verwoestte'), maar naarmate het verhaal vordert, begint ze zich geleidelijk te openen voor de assassin, die haar, ondanks haar herhaalde vluchtpogingen, steeds weer redt van gevaar en niet straft. Uiteindelijk besluit ze Altaïr te helpen door een Tempelier-spion in het verzet te doden die probeert Altaïr te vermoorden, en confronteert Bouchart samen met hem in de finale strijd. Op dit punt is ze verliefd op de assassin. Na hun ontsnapping uit het Tempelierarchief besluiten de twee om oostwaarts te reizen naar India.