Jak II

Come in Jak and Daxter: The Precursor Legacy, il gioco inizia con un discorso di Samos Hagai. Jak, Daxter, Samos e Keira stanno attivando il rift rider, il dispositivo precursore nascosto dietro la grande porta alla fine di Precursor Legacy, e la sua porta di rift accompagnatrice. Quando la porta viene attivata, una figura imponente esce, accompagnata da uno sciame di creature. Jak entra nel panico e attiva il rift rider, proiettando il gruppo attraverso la porta. Mentre viaggiano attraverso il rift, il rift rider viene distrutto. Il gruppo esce dal rift e si separa, anche se tutti si ritrovano a Haven City. Jak e Daxter atterrano e vengono immediatamente identificati da una pattuglia della Krimzon Guard, guidata dal Capitano Erol. Jak viene arrestato, mentre Daxter promette di salvarlo (vedi gli eventi di Daxter). Due anni dopo, Jak si trova nella Fortress, dove è stato sottoposto a un programma di super soldato. Il suo corpo è stato infuso con eco oscuro. Erol e il Barone Praxis sono presenti. Dichiarano che il programma 'Dark Warrior' è fallito. Se ne vanno proprio mentre Daxter compare per salvare Jak. Mentre Daxter si aggira con i vincoli, Jak si trasforma nell'obiettivo finale del programma, Dark Jak. Rompe le catene e poi torna alla normalità, dopo aver pronunciato le sue prime parole: «Ucciderò Praxis!». La coppia poi fugge dalla fortezza fino a Haven City.