Pokémon Yellow Version: Special Pikachu Edition

Tal como Pokémon Red e Blue, Pokémon Yellow decorre na região de Kanto, que apresenta habitats para 151 espécies de Pokémon. Os objetivos permanecem os mesmos, embora existam algumas diferenças ao longo do caminho. Por exemplo, no início, o jogador não tem a opção de escolher um dos três starters. Em vez disso, um Pikachu selvagem que o Professor Carvalho captura torna-se o Pokémon do jogador, enquanto o personagem rival recebe um Eevee que estava destinado ao jogador. A trama é inspirada no anime e apresenta personagens que não estavam presentes no jogo ou foram aprimorados para assemelhar-se às suas versões no anime, incluindo Jessie, James, Meowth, Enfermeira Joy e Oficial Jenny. Assim como no anime, o Pikachu recusa-se a evoluir. Os jogadores também têm a oportunidade de obter os três starters originais. À medida que os jogadores prosseguem na sua aventura, recolhem mais Pokémon e usam-nos para derrotar os oito Líderes de Ginásio e, eventualmente, a Elite Four, enquanto lutam contra a Team Rocket, uma gangue dedicada a usar Pokémon para se tornarem mais poderosos.