Crypt of the NecroDancer

No jogo principal, controlas Cadence, filha de uma famosa caçadora de tesouros que desapareceu. À sua procura, ela cai numa cripta controlada pelo NecroDancer, que lhe rouba o coração e a força a desafiar os seus súditos para o recuperar. Ela é obrigada a lutar através do labirinto da cripta, com os seus movimentos sincronizados com o ritmo da música e o batimento do seu coração, para sobreviver e derrotar o NecroDancer. Próximo do centro da cripta, Cadence encontra um dos súditos do NecroDancer chamado "Dead Ringer". Após o derrotar, descobre-se que era o seu pai desaparecido e ela o liberta do controle do NecroDancer, permitindo que ele a ajude a derrotá-lo. Eles tomam a mágica lira dourada do NecroDancer e usam o seu poder para ressuscitar a mãe morta de Cadence, Melody. No entanto, descobrem que a lira está amaldiçoada: Melody deve tocá-la para sempre para manter a vida, mas o instrumento consumirá gradualmente a sua humanidade, assim como fez com o NecroDancer. Melody regressa à cripta à procura de respostas e de uma forma de quebrar a maldição da lira. Quando Melody chega ao fim da cripta, usa a Lira Dourada para ressuscitar o NecroDancer novamente e obter respostas, mas ele a ataca e Melody o derrota. O NecroDancer tenta fugir, mas é lançado para uma fenda por Aria (a mãe de Melody), que estava num caixão com uma adaga no peito e é trazida de volta à vida pela lira. Aria revela que sabe como quebrar a maldição da lira, mas foi traída pelo NecroDancer e deixada para morrer. Decidida a terminar o que começou, ela inicia a sua ascensão fora da cripta em busca de um santuário que destruirá a lira de vez. Quando Aria chega ao santuário, é atacada pela própria lira, que se muta num enorme monstro numa tentativa de se salvar da destruição. Após derrotar a forma monstruosa da lira, Aria sacrifica a sua vida para a destruir, devolvendo a Melody a vida plena e permitindo que ela regresse à sua família, que mais tarde enterra Aria.