TMNT

Het spel volgt het verhaal uit de film TMNT uit 2007, maar vertelt het als een flashback door de schildpadden en Splinter. Na de nederlaag van hun voormalige aartsvijand, de Shredder, zijn de schildpadden als familie uit elkaar gegroeid. Leonardo reisde naar Centraal-Amerika om zijn vaardigheden als martial artist te verbeteren en zich te ontwikkelen als een gedisciplineerde leider. Hij verwerft ook een mysterieus medaillon. Tijdens zijn afwezigheid gaan de andere drie schildpadden ieder hun eigen weg. Raphael neemt een rol aan als nachtwaker, bekend als Nightwatcher, Michelangelo krijgt een baan als entertainer op kinderverjaardagsfeestjes (of als punchingbal), en Donatello wordt telefooncomputerassistent. Wanneer Leonardo terugkeert van zijn lange reis, ontstaan er direct spanningen tussen hem en Raphael. Terwijl Leonardo en Meester Splinter proberen de familiebanden te herstellen, veroorzaken mysterieuze activiteiten van de Foot Clan en monsterwaarnemingen extra problemen.