Bionic Commando: Rearmed

Bionic Commando Rearmed leent zijn plot grotendeels uit de Nintendo Entertainment System versie van het spel. In overeenstemming met de Noord-Amerikaanse release van die versie, de verwijzingen naar de nazi-partij gevonden in de oorspronkelijke Japanse titel zijn niet opgenomen in Rearded. Echter, zoals het geval is in het origineel, de laatste baas van het spel nog steeds duidelijk lijkt Adolf Hitler, en wordt aangeduid als "The Leader." De Federatie en het Rijk. Het begint met het ontdekken van geheime documenten over de ontwikkeling van een geheim wapen bekend als het Albatros project, oorspronkelijk gestart door een organisatie bekend als de Badds, maar nooit voltooid. Killt, Generalissimo van het Rijk besluit het project zelf af te maken. Als de Federatie het plan van het Rijk hoort, sturen ze hun nationale held Super Joe om het Rijk te infiltreren. Tijdens zijn missie wordt Joe gevangen genomen door keizerlijke troepen. De Federatie stuurt een tweede agent genaamd Nathan Spencer om Super Joe te redden en hem te helpen zijn missie te voltooien. Spencer doorkruist verschillende gebieden, waardoor vele keizerlijke leiders onderweg verdwijnen. Terwijl hij vordert, vindt hij nieuwe technologie en reist dieper achter vijandelijke linies. Het complot culmineert als Super Joe wordt gered van de bionische keizerlijke soldaat Gottfried Groeder, en zowel Spencer als Joe wilden het Albatros project vernietigen. Tijdens de missie ontmoet Spencer "The Leader," het herrezen hoofd van de keizerlijke troepen. Spencer verslaat The Leader, en samen met Super Joe vernietigt de Albatros. Het spel eindigt met beide helden hangen op een helikopter, vliegend als de Albatros exploderen.