Sonic the Hedgehog 3 & Knuckles

Alla fine di Sonic the Hedgehog 2, il malvagio Dr. Robotnik vede la sua Death Egg abbattuta in orbita dagli eroi Sonic the Hedgehog e Miles "Tails" Prower. Nonostante non sia completamente distrutta, la Death Egg si schianta sull'Isola Galleggiante, trascinandola con sé nel mare sottostante. Questa isola ha proprietà speciali, tra cui la capacità di levitazione magica. Quando Robotnik rileva la presenza di un enorme Smeraldo del Caos all'interno dell'isola, decide di riprendere la ricerca degli Smeraldi per far riprendere alla Death Egg la sua orbita nello spazio. Trasformando la sua sconfitta in un nuovo vantaggio, rapisce animali per convertirli in Badnik e crea nuove armi. Nel frattempo, Knuckles sta facendo la sua passeggiata abituale sull'altare degli Smeraldi per controllare il loro stato, quando improvvisamente un enorme terremoto colpisce l'isola. Knuckles vede gli Smeraldi del Caos fluttuare in aria, stupito, viene proiettato in aria e perde i sensi. Quando si risveglia, gli Smeraldi sono scomparsi, ma vede in lontananza un enorme uovo. Sorpreso, ricorda una leggenda su un antico drago destinato a distruggere il mondo alla fine dei tempi, credendo che quell'uovo misterioso sia proprio lui. All'improvviso, una gigantesca figura a forma di uovo appare e si presenta come "Dr. Eggman", spiegando a Knuckles che è arrivato per studiare quell'enorme uovo e che un riccio malvagio di nome Sonic sta cercando di interferire con le sue ricerche e rubare gli Smeraldi del Caos. Knuckles, ingannato dal dottore, parte alla ricerca di questo malfattore. Eggman sorride soddisfatto della sua abilità nel mentire. Immediatamente dopo gli eventi di Sonic 3, dove la Death Egg di Dr. Robotnik viene danneggiata in battaglia con Sonic e si schianta nuovamente sull'Angel Island. Sonic attraversa ogni zona per recuperare gli Smeraldi del Caos e sconfiggere Robotnik, venendo nuovamente in conflitto con Knuckles, che crede che Sonic stia cercando di rubare gli Smeraldi per sé. Nella Zona del Palazzo Segreto, Sonic affronta e sconfigge Knuckles. I due sentono un disturbo fuori dalla camera e, uscendo, trovano Dr. Robotnik che ruba lo Smeraldo Maestro, il segreto dei poteri di levitazione dell'isola. Knuckles tenta di attaccare Robotnik, ma viene colpito da una scarica elettrica e intrappolato con Sonic in un passaggio sotterraneo. Knuckles, rendendosi conto che Sonic è dalla sua parte, gli mostra un portale che li porta alla Sky Sanctuary, dove la Death Egg sta per essere rilanciata. Sonic riesce a infiltrarsi nella Death Egg e sconfigge Robotnik come Super Sonic. La storia di Knuckles, che si svolge dopo gli eventi della campagna di Sonic, inizia a Mushroom Hill,[b] dove si sta rilassando con i suoi amici animali, ma viene interrotto da una bomba lanciata da EggRobo. Questo spinge Knuckles a inseguire il robot, portandolo attraverso versioni più difficili delle stesse zone che Sonic ha attraversato. L'inseguimento termina sui resti danneggiati della Sky Sanctuary, dove un robot chiamato Mecha Sonic attacca Knuckles ma distrugge accidentalmente EggRobo. Dopo una breve lotta, Mecha Sonic utilizza il potere dello Smeraldo Maestro per trasformarsi in una forma Super simile a quella di Sonic. Knuckles riesce a sconfiggere il Super Mecha Sonic, che esplode. Sonic arriva pilotando il biplano Tornado e Knuckles si aggancia per riportare lo Smeraldo Maestro sull'Angel Island. Se tutti gli Smeraldi del Caos vengono raccolti, l'Angel Island si alza verso il cielo. Tuttavia, se il giocatore non ha raccolto tutti gli Smeraldi del Caos, Knuckles non può recuperare lo Smeraldo Maestro e l'isola precipita nell'oceano.