SpongeBob SquarePants: Battle for Bikini Bottom

Le jeu tourne autour du thème des robots envahissant Fond-de-Bassin, la ville natale de Bob l'Éponge. Les robots ont été créés par Plankton, le génie maléfique propriétaire du Chum Bucket, qui a construit une nouvelle machine appelée le Duplicatotron 3000 pour produire une armée de robots afin de prendre le contrôle du monde. Mais dès qu'ils sont créés, il réalise que le commutateur du Duplicatotron a été accidentellement mis sur "Ne pas obéir", et les robots le chassent rapidement du Chum Bucket avant de le prendre en contrôle. Bob l'Éponge et Patrick jouent avec des robots jouets et souhaitent qu'ils soient réels. Patrick utilise sa "coquille magique à souhaits" pour exaucer leur vœu, espérant qu'ils apparaîtront le lendemain. Bob l'Éponge se réveille pour découvrir que sa maison a été saccagée après avoir pensé jouer avec un robot. Il erre dans la maison un moment avant de recevoir un fax de M. Crab, indiquant qu'il lui donnera une spatule en or pour chaque quantité déterminée d'objets brillants qu'il collectera pour lui. À l'extérieur, Bob l'Éponge trouve un Plankton déçu, qui invente une histoire de mensonges au héros, prétendant que les robots sont apparus de nulle part et l'ont chassé. Trompé par le petit méchant, Bob l'Éponge se lance dans une quête périlleuse pour trouver des spatules en or, éliminer les robots, échanger des objets brillants contre des spatules en or auprès de M. Crab, retrouver les chaussettes volées de Patrick (emportées par les robots), qui lui donneront des spatules en or s'il rapporte dix paires, et remettre Plankton dans le Chum Bucket, incluant du saut à l'élastique, souffler des bulles, apprendre de nouveaux mouvements de bulles auprès de Bubble Buddy, et voyager à travers les rêves, entre autres.