Fallout 3

La secuencia de introducción presenta al padre del personaje del jugador, James, un médico y científico del Vault 101. James hace frecuentes comentarios sobre la madre fallecida del personaje del jugador, Catherine, y su pasaje favorito de la Biblia, Apocalipsis 21:6, que habla de "las aguas de la vida". La misión principal comienza cuando el jugador es obligado a huir del Vault 101 tras la partida de James, sumiendo el refugio en el caos y haciendo que el paranoico Supervisor envíe a sus fuerzas de seguridad tras el jugador. La búsqueda de James lleva al personaje en un viaje a través del Desierto, primero al cercano pueblo de Megatón, nombrado por la bomba atómica no detonada en su centro, luego a la estación de radio Galaxy News Radio, donde el entusiasta DJ Three Dog le da al jugador el apodo de "The Lone Wanderer" (El Errante Solitario). El jugador viaja hasta Rivet City, un portaaviones en desuso que ahora sirve como asentamiento humano fortificado. Allí conoce al Doctor Li, un científico que trabajó junto al padre del personaje del jugador. El Doctor Li informa al jugador sobre el Proyecto Pureza, un plan concebido por Catherine y James para purificar todas las aguas de la Bahía Tidal y, eventualmente, todo el río Potomac con un gigantesco purificador de agua construido en el Monumento a Jefferson. Sin embargo, retrasos continuos y la muerte de Catherine durante el parto pusieron fin al proyecto, y James llevó al personaje del jugador, recién nacido, para criarlo en la seguridad del Vault 101. Tras investigar el Monumento a Jefferson, El Errante Solitario rastrea a James hasta el Vault 112 y lo libera de un programa de realidad virtual ejecutado por el sádico Supervisor del Vault, el Dr. Braun. James y el jugador regresan a Rivet City, y James revela que buscó a Braun para obtener información sobre el Kit de Creación del Jardín del Edén (G.E.C.K.), un dispositivo que contiene los componentes necesarios para finalmente activar el Proyecto Pureza. James y el Doctor Li lideran un equipo de científicos de Rivet City hacia el monumento con la intención de reanudar el proyecto, pero el monumento es invadido por la Enclave, una poderosa organización militar formada por los restos del gobierno de Estados Unidos pre-guerra. James inunda la sala de control del proyecto con radiación para evitar que el líder militar de la Enclave, el Coronel Augustus Autumn, tome el control, muriendo en el intento (aunque Autumn sobrevive), sus últimas palabras instando a su hijo a huir. El Errante Solitario y el Doctor Li huyen hacia las ruinas del Pentágono, ahora una base de la Hermandad del Acero y conocida como la Ciudadela. Con el Proyecto Pureza aún inoperativo, incluso con la Enclave ocupando el lugar, el jugador viaja al Vault 87 para encontrar un G.E.C.K. y completar la obra de James. El jugador descubre que el Vault 87 es un sitio de prueba para el Virus de Evolución Forzada (FEV, por sus siglas en inglés) y la fuente de los Supermutantes en el Capital Wasteland. Tras obtener el G.E.C.K., El Errante es emboscado por la Enclave y capturado. En la base de la Enclave en Raven Rock, el jugador es liberado de su celda por el líder de la Enclave, el Presidente John Henry Eden, quien solicita una audiencia privada con él. En el camino hacia su oficina, sin embargo, el Coronel Autumn desobedece las órdenes de Eden y toma el mando de las fuerzas militares de la Enclave, ordenando que maten al jugador. Luchando hasta llegar a la oficina de Eden, el jugador descubre que Eden es en realidad una supercomputadora consciente de la serie ZAX que tomó el control de la Enclave tras su derrota en Fallout 2 en la Costa Oeste hace treinta años. Eden desea repetir el plan del entonces Presidente Dick Richardson usando el Proyecto Pureza, infectando el agua con una cepa modificada de FEV que la hará tóxica para cualquier forma de vida mutada. Este plan matará a la mayoría de la vida en el Desierto, incluyendo a los humanos, pero la Enclave, debido a su "pureza" genética como resultado de su aislamiento, será inmune y libre para tomar el control de la zona. Al Errante Solitario se le proporciona una muestra del nuevo FEV y se le da la opción de irse en paz o convencer a Eden de que se autodestruya toda la base. El Errante Solitario escapa de Raven Rock y regresa a la Ciudadela. Con el conocimiento que poseen, el G.E.C.K. y los medios para activar el Proyecto Pureza, la Hermandad asalta el Monumento a Jefferson, liderados por un gigante robot llamado Liberty Prime. En la sala de control del Proyecto Pureza, el jugador se enfrenta al Coronel Autumn y tiene la opción de persuadirlo para que se rinda o matarlo. El Doctor Li informa al jugador que el purificador está listo para ser activado, pero el código de activación debe ser introducido manualmente, y que la sala de control está inundada con cantidades letales de radiación. El Errante Solitario es forzado a elegir entre enviar a Sarah Lyons de la Hermandad dentro del altamente irradiado purificador o entrar él mismo. Quienquiera que entre en la cámara introduce el código sugerido a lo largo del juego, que es 21:6, y muere por un pico de radiación.